2006年11月8日、欧州委員会は、トルコのEU加盟に関する報告書を公表したが（詳しくは こちら）、その直前、ドイツ・バイエルン州の Stoiber 首相（与党CSUの党首）は、トルコとの加盟交渉を凍結すべきと発言し、波紋を広げている。11月7日付けのDie Welt 紙 によれば、Stoiber 氏は、トルコが アンカラ議定書 を誠実に履行しておらず、また、欧州委員会がネガティブな評価をしていることを考慮すると、加盟交渉の凍結はやむをえないとしている。また、ヨーロッパに属さないトルコはEUに加盟しえず、強力な近隣関係を構築すべきであると述べている（参照）。

　保守系政党である CDU（キリスト教民主同盟）と CSU（キリスト教社会同盟）は、かねてより、トルコのEU加盟に異議を述べており、この立場は今日でも変わっていない（詳しくは こちら）。Stoiber 首相は、保守色の強い南ドイツ・バイエルン州を活動拠点とする CSU の党首であるだけに、その発言は驚くに値しないが、両党と連立政権を組む SPD （ドイツ社会民主党）は、トルコのEU加盟は、トルコだけではなく、EUにとっても大きなプラスとなるとし、従来どおり、その加盟を支持している。また、加盟交渉は始まったばかりで、結論（トルコの加盟実現）がすでに決まっているわけではないとし、連立政党党首の発言に反発している（参照）。

　2005年秋に発足したドイツの大連立政権は、トルコのEU加盟問題だけではなく、国内問題でも足並みを乱しているが、前者に関し、Merkel 首相 は、CDU・CSU と SPD の調整役を担わされるようになっている。CDU の党首としては、従来どおり、トルコのEU加盟に反対しているが、ドイツ首相としては、トルコとの合意を守るべきであるとし（参照）、早急な判断を避け、トルコが自発的に アンカラ議定書 を批准・履行するのを見守っている。

　トルコとの加盟交渉について、EU加盟国政府は、12月中旬の欧州理事会で決定する予定であり、それまでに欧州委員会は提案を行うとされている（詳しくは こちら）。オーストリアの日刊紙 Die Presse は、12月6日に委員会の見解が示されると報じているが（参照）、これを受け加盟国外相会議（EU理事会）は12月11日に開催され、14･15日の欧州理事会に備えることになる。なお、フィンランドの Tuomioja 外相は、12月の欧州理事会が「トルコ会議」になることを牽制している（参照）。

Merkel 首相、CDU党首としては、トルコのEU加盟に消極的